Hola Stelita y bienvenida a los foros.
Mira antes que nada cabe decirte de que los discos de windows 98 no tienen booteador, a menos que el q compilo ese disco de Windows lo halla integrado.
Lo que tendrías que hacer es crear un disco de inicio, que entre otras cosas trae el FORMAT para formatear y los controladres en tiempo real para la unidad de CD-ROM.
Aca te dejo un link donde podes encontrar los discos de inicio para tu sistema operativo:
www.bootdisk.com -- TODOS LOS DISCOS DE INICIO.
Especificamente el de Windows 98:
Disco de Inicio - Win98Tiene incluidos los controladores ramdrive y de CD.
Una vez que bootees desde el diskette le das a "Iniciar PC Con compatibilidad para CD-ROM".
Después cuando estás esperando el prompt, pones FORMAT C:.
Después para instalar el Windows, pones "CD E:\" donde E:\ es la unidad de CD que dice el instalador.
Y de hay pones DIR. Si ves una carpeta que dice "Win9x" o "Win98" ponés CD Win98. y luego Setup.exe o Instalar.exe --
Si no ves ninguna carpeta, pones directamente Setup.exe o Instalar.exe --
Cualquier cosa posteas
saludos
Vitrox.