no es mas facil abrir el ms-dos yendo a ejecutar -> cmd
y a continuación poniendo el comando convert
aqui te dejo los parámetros de los que dispone.. me parece a mi que será mas facil asi, bueno un saludo

CONVERT unidad: /FS:NTFS [/V] [/CvtArea:nombre_archivo] [/NoSecurity] [/X]
volumen Especifica la letra de unidad (seguida por dos puntos)
el punto de montaje o el nombre de volumen.
/FS:NTFS Especifica que el volumen se convertirá a NTFS.
/V Especifica que Convert debería ser ejecutado en modo
detallado.
/CvtArea:nombre_archivo
Especifica un archivo contiguo en el directorio raíz para ser
el marcador de posición para los archivos de sistema NTFS.
/NoSecurity Especifica la configuración de seguridad de archivos y
directorios para que estén disponibles a todos.
/X Fuerza a que el volumen se desmonte si es necesario.
Todos los identificadores abiertos al volumen no serán
válidos.