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Hola katanagari.
Este es un tema muy debatido pero sin conclusiones claras. Yo te puedo aportar un par de apuntes:
Los tres son Journaling, los tres soportan ACLs (para tu samba).
ext3: es el viejo ext2 con Journaling, este es su peor defecto y su mayor virtud. Defecto por que es el mas anticuado y el de peor rendimiento y virtud por que es el mas conocido , el mas textado y el que cuenta con mas herramientas si hay problemas. reiserfs : especialmente bueno con archivos pequeños. jfs - tecnología IBM diseñado especificamente para servidores (de los de verdad)- 64 bits.
No has mencionado: XFS - especialmente bueno con archivos grandes - 64 bits.
Para una red y unos servidores en plan domestico las diferencias de rendimiento serian insignificantes. La opción conservadora: ext3. La opción osada: reiserfs o XFS, dependiendo del tamaño de los archivos (grande = cientos de MB o más) La opción sabia: probarlos todos.
Seguro que no hace falta que te lo comente, pero pensando en otros posibles lectores: Distintas particiones pueden tener distintos sistemas de archivos... se puede ser conservador, osado y sabio al mismo tiempo.
Att. un pingüino.
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