Yo desfragmente los 2 discos duros, antes de ayer.... tarda bastante pero es muy bueno, la desfragmentacion no deveria fallar en nada, ya que el SO no lo toca.
(si quieres comprobarlo: mi pc> disco local (C:)> clik derecho> propiedades> herramientas> desfragmentar ahora> analizar(tarda max 10 seg))
si haces esto veras una franja con colores, mucho rojo

poco azul, y algo de verde, lo verde representa el SO, y esto no lo toca, lo que hace es coger lo rojo y re-organizarlo.
en un principio desfragmentar es muy recomendable, ya que ganas espacio en el disco duro, y notaras que va bastante mas rapido.
unas recomendaciones: quita el salvapantallas, y deja al ordenador trabajar(no utilices programas, ni entres en internet ni nada) (problamente esas personas no hicieron eso, y despues mira lo que pasa....)
espero haberte ayudado
hasta luego