Gracias Died por tu ayuda.
Ahora comprendo que todo va en la cuenta de usuario que se cree en win2000 y la contraseña.
Primero probé con la cuenta del usuario y no funcionó, asi que coloque la cuenta de administrador de win2000 en el pc de win98 y finalmente conectó. Después estuve haciendo pruebas validando e invalidando la contraseña del usuario en win2000 y probandolas en win98. Obviamente que invalidando la contraseña en win2000 aparecerá el simbolo IPC$ en win98.
En resumen: la persona con win98 seguira entrando con su contraseña habitual, y el recurso compartido será administrado exclusivamente por el propietario de win2000 quien para establecer conexión cambiará la contraseña en opciones avanzadas de las cuentas de usuario de ese S.O. y para cortar la conexión reemplazará la contraseña por una que no utilize win98.
Hasta pronto

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