En las FAQ de Mindsoft lo unico que se habla al respecto es esto:
Fuente:
http://72.14.207.104/search?q=cache:mOMG1_...Utilities&hl=esQUOTE
Shelter is not able to decrypt my encrypted folder and shows an error message
If you encrypt a folder, for example 'C:\Copies' and then you rename it, change it or move it, Shelter won't be able to find the original path or the files in it. That's why you should keep the encrypted folders untouched to avoid problems.
PD:
Si no te ha pedido ninguna password, es posible que el programa no este encriptando realmente los archivos, intenta acceder a los mismos desde otro sistema operativo, por ejemplo desde un sistema basado en linux, esto funciona con los archivos protegidos por hide folders y demas programas parecidos.
Cuando quieras encriptar archivos, te aconsejo usar cryptoforge, es el programa que yo utilizo desde hace años y sin el menor problema.
http://www.trucoswindows.net/foro/showtopic-207.html