Hola luna... lo primero que dices es que no tienes ningún programa que arranca al inicio? de ser así no me extraña que te vaya lento el arranque.
Los motivos pueden ser miles de porqué un pc arranca lento pero no sé me oriento porque primero nos des más datos sobre la máquina y el antivirus que usas por ejemplo. En caso de que sea panda no te extrañes que te arranque lento ya que se "come" literalmente los recursos
Cuando inicies el ordena en Ejecutar escribe msconfig y vete a la pesataña inicio postea aqui los programas que se inician a ver si te podemos echar un cable.
Aunque sigo pensando que hay troyanos mu malos en tu disco duro