Habría que ver qué está causando conflictos... ve a Panel de Control, Herramientas Administrativas, Visor de Eventos... y fíjate si hay alguno con redondel rojo y cruz blanca dentro. Al darle a propiedades verás de qué aplicación se produjo el fallo. Más o menos por la hora en que sucedió te darás cuenta cuál es.
Seguramente sea algo que has instalado últimamente, que está causando conflicto con edonkey. O que estés bajando muchos archivos, o que estés compartiendo muchos. Ya probaste reinstalar edonkey? El emule te hace lo mismo?
Y de última fíjate qué dicen por el foro oficial en español:
http://forum.edonkey.com/viewforum.php?f=41Salu2.
@Sonic999