De acuerdo a mi experiencia si vas a tener los 2 sistemas operativos recomiendo que tengas a windows en la primera particion y a linux en la siguiente, asi que te aconsejo que hagas un respaldo de tu info, formatees el disco instales windows y ya despues linux, automaticamente se instalara un boot loader (administrador de arranque) que te permitira escoger entre los 2 sistemas.
esa es mi opinion...
si alguien recomienda lo contrario y sabe como hacerlo se agradece
Un saludo