holas.... una buena forma de empezar es googlear... busca lo que se llama dualboot... pero pa darte una idea general... lo que tienes q hacer (lo mas facil) es instalar el windows en una unidad con el formato que quieras, tener otra unidad con fat32 para q te sirva de "puente" para pasar archivos de un sistema al otro... y dejar otra parte del disco duro sin formato para instalar el linux (aunq lo mejor si tienes dos HDD y el linux lo pones en el otro

)... el linux instalara un bootloader (grub o lilo) y asi cuando prendas la compu tendras la opcion de elegir en q sistama quieres trabajar (lo digo x si no lo sabias)... ahora... que dependiendo del linux q quieras usar tendras q consultar su manual de instalacion... salu2