Me gustaria saber donde guarda (en que archivos) el windows 2000 exchange server toda la informacion de las cuentas de los usuarios (nombres de las cuentas, contraseñas, etc.)o al menos que sistema usa para comprobar que el usuario y la contraseña escritas son correctas cuando inicio sesion.

Prueba con esto:
http://www.meste.cl/soluciones/dme.htm

Pero no te diremos exactamente como es, ya que por medio de Windows 2000 podemos cambiar contraseña, pero modo administrador, si no lo eres no podrás.
Además suena que quieres hacer algo indebido.

Saludos.