Metes el CD de Windows Vista. Booteas con el mismo CD. Sigues los pasos de instalación. En el momento que pregunta donde instalar todo, buscas el disco y le das formatear. El programa se encargará del resto. Por último instalas en esa partición que acabas de formatear...
NOTA: Todos los datos del disco rígido que formatees se perderán para siempre y no puedes volver atrás.
Si no te bootea automáticamente metete en el menú para arrancar desde... pulsando f11 al encender tu pc (por lo menos amí me pasaba lo mismo y me funcionó), saludos