Software para digitalizar documentos no conozco ningún software decente y más a esa escala que quieres.
Yo haría lo siguiente:
Buscar un software de digitalizacíon que cubra todas tus necesidades.
Comprar una SAN estilo
SAN1 o
SAN2. Con esto evitaras cargar al servidor solo de datos. Nos interesaría pasar la gestión de esos datos por el servidor pero no dejarlos en el ya que de esa forma lo saturamos.
Otra de las opciones es aumentar la velocidad del servidor hacía la red para facilitar los accesos a datos que sean ágiles y rápidos.
Más o menos esto te saldrá unos 6000€ , SAN y backup 3000€ Programa de digitalización más scanner's 2000€ y actualizar Swith y tarjetas de red 1000€