los prodras usar con todoa normalidad, por decirlo de alguna manera, los deja hay reducidos para no estorvar. Suele eliminar archivos temporales, mas clickeados, sin menos uso, etc, etc... esto puede incluir hasta las propias cookies o elimina los archivos antiguos dl sitema que tiene una version mas reciente o mejor en el propio equipo. si quieres ver los archivos que elimina fijate en este link:
http://support.microsoft.com/kb/188099/es o ejecuta el liberador de espacio pincha sobre el elemnto a liberar y si te fijas te aparece ver archivos un poco mas abajo. Tambien te aconsejaria una desfragmentacion y casi hacer un log hitachi. un saludo