Hola
Javier_92 y bienvenido.
Los ventiladores, en general, están siempre en marcha. Otra cosa es que te hagan un ruido molesto que puede ser debido a mal funcionamiento, suciedad o polvo almacenado, etc.
Pero de quererlo, podrías descargar un programa como
SpeedFan que se utiliza para monitorizar las temperaturas del equipo y que también sirve para indicarle a que temperatura deben de empezar a girar los mismos de manera automática.
Particularmente no me gusta esta opción, prefiero tener el interior del equipo bien ventilado que correr el riesgo de sobrecalentamiento con los graves problemas que esto acarrea.
Mi consejo sería, para aminorar el ruido del giro de los ventiladores, abrir la torre, limpiarlos con una brocha suave del polvo acumulado y en caso de tener dudas cambiar el que sea demasiado ruidoso ya que tal vez no trabaje como es debido, no son nada caros ni difíciles de instalar. Suerte.