El archivo de subtitulos 140MB?? no puede ser eso... ni siquiera estando en formato de imagenes puede pesar eso, y de por si no puede estarlo en ese formato porque el filtro subtitler del VirtualDub solo soporta SSA, que es formato texto.
El problema claramente es que no esta recodificando el video, o algo similar.
No se que decis sobre el paquete de codecs del xvid, supongo que sera al reves, esa es la version del xvid que trae el pack, o esa es la version del codec XviD que tenes instalada. A ver si aclaramos esto, los codecs o packs se pueden ver instalados en Agregar y Quitar, si tenes algun pack segui estos pasos donde dice solucionar problemas de
aqui, aunque no instales los FFDSHOW ni el codec DivX, con el XviD y el AC3Filter vas bien por ahora.
Luego, una ves tengas el XviD oficial instalado, probas de nuevo a pegar los subtitulos.