hola me gustaria que me dijeran con que programa o como yo pego un subtitulos con colores distintos que he visto que muchas series animes las subtitulan asi y me gustaria saber

Para eso se usa el programa Aegisub. Crea un archivo de subtitulos ASS, que podes pegar al video con el plug-in del VirtualDub VSFilter, que podes bajar de aca. Dicho filtro soporta el formato ASS, el otro que se usa en el manual de esta web es el filtro subtitler, pero ese no sirve, solo soporta SSA, un formato mucho mas simple que no permite tanta personalizacion.

Para todo lo demas te podes guiar con la guia comun -> AQUI