Tal parece que los ffdshow son capaces de lidiar con ese codec jpeg raro, asi que podes desinstalar cualquier otro codec que hayas instalado con ese proposito.
Tambien entra en la configuracion del AC3Filter y en pestaña System desmarca la casilla que dice PCM.
En cuanto al viejo WMP que se instalo, no tengo idea...
El unico problema con este codec 3ivx es que es de pago, por lo que lo que descargaste e instalaste es una version de prueba.
Estuve leyendo sobre como sacarse de encima el maldito contenedor MOV y asi evitar el codec 3ivx, y encontre que puede funcionar pasarlo a MP4 o incluso a AVI, necesitando a lo sumo el Haali Media Splitter si se usa MP4, que es gratuito.
Proba de hacerlo con el programa YAMB como se explica en esta
guia, siendo necesario para poder cargar el archivo al programa, renombrar el archivo de .mov a .mp4, cargas el archivo y lo guardas como .mp4 y/o .avi, en teoria funciona en ciertos casos, no se que pasara con este formato de video rarisimo jpeg, pero no se pierde nada intentando.